ד"ר ניר נפתלי סיים תואר שלישי ושני בהצטיינות במחלקה למדעי אנרגיה ואיכות הסביבה במכון וייצמן למדע, לאחר קבלת תואר ראשון בהצטיינות מבי"ס לפיסיקה באוניברסיטת ת"א.
במסגרת עבודות המחקר שביצע במגדל השמש, עסק רבות באנרגיית השמש לרבות תאים פוטוולטאים לאור שמש מרוכז, ושימש כיועץ לגופים שונים שבאו לבצע מחקרים בתחום אנרגית השמש, כגון התעשייה האוירית. עבד כפיסיקאי בכיר בחברת הזנק (Edge medical devices) בפיתוח מערכת הדמיה רפואית ובאלביט מערכות בפיתוח מערכות הגנה מתקדמות. הקים וניהל את מעבדת הפיתוח בחטיבת אינפרא אדום ומערכות מוכללות, אלביט מערכות.
כמומחה בתחום, העוקב אחר הפיתוח בעיקר בארץ בעשור האחרון, הצטרף לסגל ההוראה של בית הספר בכוונה לקדם את תחום האנרגיה החילופית.